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银行手续费发票可以抵扣进项税。
银行手续费的增值税专用发票在某些情况下可以用于抵扣进项税额。根据财税〔2016〕36号文件，银行开户时支付的手续费属于直接收费金融服务，因此可以取得增值税专用发票并按规定抵扣进项税额。然而，对于与贷款直接相关的投融资顾问费、手续费、咨询费等，其进项税额是不允许从销项税额中抵扣的。此外，进项税额的抵扣还受到其他限制，例如用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或个人消费的购进货物、劳务、服务等，其进项税额也不得抵扣。因此，企业在使用银行手续费发票抵扣进项税时，必须注意这些规定。
银行手续费的开票规定：
1、开票主体：银行或金融机构作为服务提供方，负责开具发票；
2、发票类型：通常为增值税专用发票或普通发票，根据交易性质和客户需求确定；
3、税率应用：根据国家税务总局规定的税率进行开票，银行服务通常适用的税率较低；
4、信息准确性：发票上需详细列明服务内容、费用金额等信息，确保准确无误；
5、发票用途：企业可用于会计核算，个别情况下可用于税务抵扣；
6、开票时间：服务完成后，银行应及时开具发票给客户。
综上所述，银行手续费发票可以抵扣进项税，但需注意相关规定限制。
法律依据：
《中华人民共和国增值税暂行条例》
第八条
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。进项税额计算公式：进项税额=买价乘以扣除率
（四）购进或者销售货物以及在生产经营过程中支付运输费用的，按照运输费用结算单据上注明的运输费用金额和7%的扣除率计算的进项税额。
金融服务费发票不能抵扣。
银行手续费可以开具增值税专用发票，但并非所有手续费都能抵扣进项税额。根据《营业税改征增值税试点有关事项的规定》，与贷款直接相关的投融资顾问费、手续费、咨询费等支付给贷款方的费用，其进项税额是不允许抵扣的。然而，银行开户时交纳的手续费属于直接收费金融服务，可以开具增值税专用发票，并按规定抵扣进项税额。而票据贴现服务是不允许抵扣进项税额的，因为只有同时用于一般计税方法和简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或个人消费的项目的进项税额，才能全额抵扣。
金融服务费的税务处理：
1、金融服务费的定义：金融服务费通常指的是金融机构为提供贷款、理财、保险等服务所收取的费用；
2、发票开具：金融机构在收取服务费时，会根据规定开具相应的发票或收据，作为交易凭证；
3、抵扣规则：在税法规定中，金融服务费发票通常不属于可以用于增值税抵扣的范畴；
4、税务申报：企业在进行税务申报时，需要按照税法规定正确处理金融服务费用，确保申报的准确性；
5、税务筹划：企业在进行财务管理和税务筹划时，应考虑金融服务费用的税务处理方式，以合理规避税务风险。
综上所述，金融服务费发票不能抵扣，而银行手续费可以开具增值税专用发票，但并非所有手续费都能抵扣进项税额。
法律依据：
《中华人民共和国增值税暂行条例》
第十条
金融保险业增值税的计税依据为销售服务、无形资产、不动产的价款和价外费用的合计额。金融保险业增值税的计税依据中不包括增值税税额。金融保险业增值税的纳税义务发生时间，按照国务院财政部门的规定执行。金融保险业增值税的扣除项目，按照国务院财政部门的规定执行。
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